Protéger la nature et l'environnement de tout acte entrainant la destruction ou l'endommagement irrémédiable d'un écosystème par un facteur anthropique intentionnel ou non, dans la perspective humaniste d'une société responsable et solidaire, et donc notamment de concilier les enjeux face à la transition écologique, d'agir afin de préserver les espaces, ressources, milieux et habitats naturels, les espèces animales et végétales, la biodiversité et les équilibres fondamentaux de la biosphère : l'eau, l'air, le sol, le sous-sol, les sites et paysages, d'assurer une mission d'intérêt général en participant au débat public, d'accompagner la transition énergétique, de lutter contre les pollutions et les nuisances, d'agir pour la préservation de la santé et de la qualité de vie des habitants, d'oeuvrer pour un aménagement soutenable du territoire et une approche environnementale pour un urbanisme économe, harmonieux et équilibré, de prévenir les dommages écologiques et les risques naturels, technologiques et sanitaires, de participer à l'éducation à l'environnement et au développement durable, de favoriser la mise en synergie des associations en Côte-d'Or, de promouvoir et veiller à la diffusion et au développement d'une information environnementale et sanitaire, vraie et loyale, d'assurer le lien entre ses adhérents, France Nature Environnement et France Nature Environnement Bourgogne Franche-Comté, d'ester en justice chaque fois que cela s'avère nécessaire pour les dossiers dont elle a la charge, la fédération intervient en cohérence avec les territoires concernés, si besoin au-delà des limites administratives du département